新生儿眼屎多常常是结膜炎的表现之一。婴儿从母体内分娩出时，母亲产道内的病菌可侵入孩子的眼中；平时卫生习惯不好，用不清洁的手擦了宝宝的眼睛，也可能引起结膜炎。与大孩子或成人所不同的是，引起新生儿结膜炎的病原体大多不是病毒，而是细菌。

引起新生儿结膜炎最常见的致病微生物为衣原体和球菌。

衣原体结膜炎

衣原体是寄生在细胞内的一种微生物，婴幼儿期可引起结膜炎和肺炎，多是有父亲或母亲引起。感染可发生于宫内（即分娩前）及分娩过程中（产时）阴道分泌物污染。潜伏期间5~13天，比细菌性结膜炎发病晚。脓性分泌物（即眼屎）会在数周、数月后自行消散，结膜不留疤痕，也不累及角膜。在宝宝出生后就点1%红霉素眼药水，每天3次，共2～3天，基本上可以预防。

衣原体结膜炎的治疗一般都需用抗生素，多是药水和药膏交替，白天点药水，晚上用药膏，最好到分泌物消退后，再坚持用一个星期，以免反复。特别顽固的结膜炎，药物治疗效果不好，可考虑将分泌物做细菌培养和药物敏感试验，作为选药的依据。泪囊炎在药物无效时，可考虑泪道冲洗或泪道探通术。大多数宝宝患结膜炎后，经过药物治疗是可以完全治愈的，而且不会影响视力，个别因治疗不当或不及时，有转为慢性的可能，但很少有角膜并发症，所以不会导致视力受损。