祖国医学有“医食同源”之说。选择使用药膳时，应注意药物与食物之间的搭配禁忌，即每种药物及食物均有各自的偏属性味，若搭配不当，则会减弱药效，从而影响药膳效用。比如：萝卜忌人参，羊肉忌半夏，菖蒲、猪肉反乌梅、桔梗等。另外，药膳的调味品必须以保持药膳中药材自身性味为原则，不应掩盖或破坏药膳原料的性味，以免削弱或丧失食药原有功效。

选择药膳应该因人、因地、因时制宜，忌简单拿来，盲目袭用。如老年人气血衰少，生机减退，选择药膳时应以补肝肾为主；小儿生机旺盛，但气血未足，脏腑娇嫩，选择药膳时应以调整脾胃功能为主，不宜使用补剂。另外，选择药膳需顺乎时令，合乎时序。如春季感冒，多为风温之症，宜选择辛凉透表、清热解毒；夏季发热，则多为暑湿之证，宜选择发汗解表、化湿祛暑。再就养生调补药膳而言，春季宜升补，夏季而清补，秋季而平补，冬季而滋补。

选择药膳应了解疾病的性质。热性病宜用寒凉性药膳，忌辛热之品；寒性病宜用温热性药膳，忌咸寒之品。脾胃虚弱、消化不良忌油腻食物；疮疡、肿毒、过敏性皮肤病者忌鱼、虾、蟹、酒、猪头、葱、韭菜等易动风、助火、生痰的食品，以免加重病情。