软组织肿瘤的病理诊断较困难，例如纤维肉瘤，纤维型滑膜肉瘤，恶性纤维组织细胞瘤等经常混淆。近年来应用多种标志物进行软组织肿瘤的免疫组化研究可根据其染色表现型提供组织学诊断依据。

常用抗血清诊断标记：

1、波形蛋白（Vimentin），用于鉴别癌与肉瘤。

2、结蛋白（Desmin），用于诊断平滑肌源性肿瘤，横纹肌肉瘤，腺泡状软组织肉瘤等。

3、肌红蛋白（Myoglobin），横纹肌肉瘤多为阳性。

4、S-100蛋白（S-100protein），主要用于周围及中枢神经系统肿瘤的诊断。

5、a1抗胰蛋白酶（a1—AT），a1抗糜蛋白酶（a1-ACT）可作为恶性纤维组织细胞瘤及组织细胞来源肿瘤66诊断。

6、第八因子相关抗原（F8），作为血管肉瘤的诊断。

7、角蛋白（Keratin），用于间皮肉感上皮样肉瘤，上皮型滑膜肉瘤的鉴别诊断现代细胞定量技术，如流式细胞仪，自动图像分析仪以及分子生物学技术的研究也逐日增多，推动了病理学的进展。

延伸阅读：软组织肿瘤与癌的鉴别

软组织肉瘤与癌的生物学特性不同，简谈如下：肉瘤生长方式多为离心状球形增大，而癌多呈浸润状生长；肉瘤常有一层“假包膜”，实质上这是肿瘤的包膜，即存在肿瘤细胞，但外科医生常误认为此包膜为真正的包膜，而手术范围不够，造成复发；肌肉筋膜及肌腱可以阻挡肿瘤的扩延。软组织肉瘤易发生血道转移，但淋巴结转移并不多见，但一旦发生，预后同样较差；低度恶性肉瘤常易局部复发，而高度恶性肉瘤可能同时复发或转移；肿瘤大小与预后有关，小于5厘米的肿瘤预后好，而大于5厘米的肿瘤预后较差；小儿的软组织肉瘤预后好，成人较差。儿童的软组纵肿瘤对化、放疗敏感，成人次之。