遗传因素：部分患儿与遗传因素有关，遗传因素对孤单症的作用已趋于明确，患本病的儿童同胞中有2%-6%患本病，单卵双生子同病率高达36%。

家庭因素：父母是专业技术人员，受过高等教育，比较聪明，但做事刻板，并有强逼倾向，对孩子冷淡和顽固，家庭缺乏暖和。

脑器质性损害：如产伤、宫内窒息、感染、中毒等，15%-50%的患儿伴癫痫发作、脑电图异常、脑CT、磁共振有非特异性改变。有的伴有神经系统体征、躯体畸形等。先天性风疹病毒感染、巨细胞病毒感染均可能与自闭症发病有关。

环境因素：早年生活环境中缺乏丰富和适当的刺激，没有教以社会行为。或长期处在单调环境中的儿童，会用反复动作来进行自我刺激，对外界环境就不发生爱好。