要知道正常的女性朋友不孕率约为l5%，内膜异位症患者可高达40%。重度子宫内膜异位患者不育的原因可能与盆腔内器官和组织广泛粘连和输卵管蠕动减弱，以致影响卵子的排出、摄取和受精卵的运行有关。

盆腔解剖无明显异常的轻症患者亦可继发不育，不育的原因绝非单纯局部解剖异常所致。现多认为是子宫内膜异位的情况造成的。

黄体期功能不足，内膜异位患者卵泡和黄体细胞上的LH受体数量较妇女为少，以致黄体期黄体分泌不足而影响受孕。

内膜异位患者体内B淋巴细胞所产生的抗子宫内膜抗体可干扰早期受精卵的输送和着床，腹腔内巨噬细胞增多亦可吞噬精子和干扰卵细胞的分裂从而导致不孕。