生殖器疱疹在潜伏期会让人在不知不觉得情形下成为疱疹的传播者和受害者，所以要做好预防的措施。生殖器疱疹的传染源是患者及亚临床无症状的带病毒者，尤其是在患者的生殖器皮肤或粘膜的疱疹内含有单纯疱疹病毒，可通过性接触而传染给配偶或其他性侣，也可在同性恋者中互相传染。有时在口腔或口腔周围患有疱疹的人，可通过口腔和生殖器性交，使对方患上生殖器疱疹。

因此，不同方式的异性性行为，也可传播生殖器疱疹病。生殖器疱疹是由病毒引起的，分为1型和2型，出现在唇或鼻周的疱疹常为1型，而出现在生殖器区的疱疹常为2 型，它感染的范围还可累及眼、脑或脑膜，主要是藉由已感染的分泌物直接接触传染。一旦感染生殖器疱疹，治愈的机率就很低，药物治疗只能减轻症状而已，而且很可能会重复发病，随患者本身的疾病病况或情绪紧张而突然再出现。

生殖器疱疹在潜伏期的传染性是很高的，正确的使用保险套可以降低传染生殖器疱疹的风险。研究表明，平均有四分之一的人处在生殖器疱疹潜伏期的传染性强的时期，其中只有五分之一的人知道自己已经患了疱疹。

不过由于在潜伏期是没有任何症状的，所以这些患者就在不知道自己已经感染了疱疹的情况下，经由性接触时体液的交换将生殖器疱疹病毒传染给别人，由此可以看出生殖器疱疹传染性在潜伏期也有很强的传染性。对成人来说，生殖器疱疹病毒并不会致命，可是患有疱疹的孕妇却可能在分娩的过程中把病毒传染给新生儿，伤害新生儿的脑部，严重者还会夺走小宝宝的生命。