初次感染病毒，通常从接触到发病约2-10 天，也即是潜伏期。生殖器疱疹患病部位先有炙烤感，很快在红斑基础上发作3-10个成群的赤色丘疹，伴有瘙痒，丘疹很快成为小水疱，3-5天后变为脓疱， 破溃后构成大片的溃烂和溃疡，自觉痛苦，最终结痂愈合。生殖器疱疹全部病程可继续20天摆布。

大多数女人病人双侧腹股沟淋巴结肿大。后期炎症涉及尿道、膀胱时，可呈现排尿困 难、尿痛、尿频、严重者可发作尿潴留等景象。

还可能有其它表现一起呈现，如发热、全身不适、头痛、颈项强直、脑膜炎和骶部神经系统功用不全。26%女人的原发性生殖器疱疹病人一起伴有生殖器以外的病损，主要在臂部与手指，多见生殖器呈现疱疹后的第2周，大多是受感染的生殖器部位的病毒本身接种而致。